מה ההבדל בין 16s rRNA ל-18s RRNA?

2024 מְחַבֵּר: Miles Stephen | [email protected]. שונה לאחרונה: 2023-12-15 23:36

הראשי הבדל בין ביצוע ניתוחים עם 18S rRNA נתוני גנים במקום 16S rRNA נתוני גנים (או נתוני ITS) הם מסד הנתונים הייחוס המשמש לבחירת OTU, ההקצאות הטקסונומיות ובניית היישור מבוסס התבנית, מכיוון שהוא חייב להכיל רצפים אוקריוטיים.

בהתחשב בכך, מדוע משתמשים בגן rRNA 16s לזיהוי?

ה גן RNA ריבוזומלי 16S מקודד לרכיב ה-RNA של תת-היחידה 30S של הריבוזום החיידקי. בגלל המורכבות של הכלאה של DNA-DNA, גן rRNA 16S רצף הוא בשימוש ככלי ל לזהות חיידקים ברמת המין ומסייעים בהבחנה בין מיני חיידקים קרובים [8].

בנוסף, האם לאאוקריוטים יש rRNA 16s? ה 16S rRNA הגן קיים בכל החיידקים, וצורה קשורה מתרחשת בכל התאים, כולל אלו של איקריוטים.

השאלה היא גם מה זה rRNA של 18 ו-28?

ה 28S / RNA ריבוזומי 18S יחס משמש לעתים קרובות כדי להעריך את איכות ה-RNA הכולל שטוהר מכל מדגם נתון. בבני אדם, 28S rRNA יש ~5070 נוקלאוטידים, ו 18S יש 1869 נוקלאוטידים, מה שנותן א 28S / 18S יחס של ~2.7. גבוה 28S / 18S יחס הוא אינדיקציה לכך שה-RNA המטוהר שלם ולא התפרק.

מהו רצף rRNA 16s?

16S rRNA גֵן סדר פעולות אנליזה היא שיטה סטנדרטית בטקסונומיה וזיהוי חיידקים, והיא מבוססת על זיהוי של סדר פעולות הבדלים (פולימורפיזמים) באזורי ההיפר-משתנים של 16S rRNA גן הקיים בכל החיידקים.